Він обіймав посаду голови зовнішньополітичного відомства за президентства Біла Клінтона. Під час виборів глави держави 2000-го року, з мінімальною різницею між Джорджем Бушем та Альбертом Гором, Уорена Крістофера відправили перераховувати голоси виборців у Флориді. Потому Верховний суд США вирішив суперечку на користь - Буша-молодшого. Окрім того, у 2005 році  колишній Держсекретар закликав Конгрес США не ухвалювати резолюцію про геноцид вірмен.